安徽省人乳头瘤病毒16型全基因组的结构特征

• 作者: 孙云峰 江彤 陈传俊
• 来源期刊: 安徽医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 人乳头状瘤病毒16型 全基因组 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（10）
• 所属期刊栏目: 临床医学研究
• 页码范围: 1456-1459,1460
• 页数: 5页
• 分类号: R730.261
• 字数: 2940字
• 语种: 中文

摘要

目的克隆安徽省人乳头状瘤病毒16型( HPV16)全基因组,分析HPV16全基因组序列并了解其结构特征。方法收集5例安徽省宫颈癌病理组织标本并提取总DNA,设计4对特异性引物分段克隆HPV16全基因组,测序后进行序列拼接及核苷酸序列分析。结果检测到1个宫颈癌病理样本中含有 HPV16并获得全基因组序列,序列全长7906 nts ( GenBank登录号：KC935953)。序列比对显示,安徽HPV16( HPV16-Anhui )与泰国HPV16和日本HPV16的全基因组核苷酸序列相似性最高,达99.5%。系统关系树分析显示,HPV16-Anhui与其他7个HPV16型聚成1个单独的分支。结论获得安徽省首例HPV16全基因组核苷酸序列,HPV16-Anhui与不同地区 HPV16亲缘关系均较近且基因组变异性较小。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	江彤	安徽农业大学植物保护学院	62	201	6.0	10.0
2	陈传俊	安徽医科大学第三附属医院合肥市第一人民医院口腔颌面外科	30	105	6.0	7.0
3	孙云峰	安徽医科大学第三附属医院合肥市第一人民医院口腔颌面外科	3	1	1.0	1.0