应用基因芯片技术筛选转染CDX2基因后胃癌细胞差异表达基因

• 作者: 储婧 秦蓉 陈宗科 陈晓双
• 来源期刊: 安徽医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 胃肿瘤 尾侧型同源转录因子-2 基因芯片 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 基础医学研究
• 页码范围: 730-734
• 页数: 5页
• 分类号: R735.2
• 字数: 3679字
• 语种: 中文

摘要

目的：观察转染 CDX2基因后人胃癌细胞系 BGC-823基因表达谱的变化。方法通过脂质体介导法转染pEGFP-C1-CDX2和空载体pEGFP-C1至人胃癌细胞系BGC-823中,经G418筛选后获得稳定转染细胞,逆转录-聚合酶链反应( RT-PCR)检测CDX2基因的表达。应用人类表达谱芯片Affymetrix 2.0对两组细胞同时进行基因芯片分析,筛选出差异表达基因(以表达差异≥2.0或≤0.5倍为限),选择部分差异表达基因进行实时荧光定量逆转录聚合酶链反应( Real-time PCR)验证。结果基因芯片筛选出CDX2转染人胃癌细胞BGC-823差异表达基因599个,其中上调基因275个,下调基因324个,这些基因主要涉及细胞增殖、分化、凋亡、信号转导、蛋白酶活性、肿瘤侵袭和转移等方面；Real-time PCR 检测部分差异表达基因 DKK3、FOXP1、TWIST1、GATA6、RUNX3和BMP2,其结果与芯片结果一致,确定芯片结果可靠。结论应用人类表达谱芯片成功筛选出CDX2转染人胃癌细胞BGC-823后差异表达基因,为深入探讨CDX2在胃癌中的作用机制提供线索。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦蓉	安徽医科大学基础医学院病理学教研室	43	302	10.0	15.0
2	储婧	安徽医科大学基础医学院病理学教研室	5	30	3.0	5.0
3	陈晓双	安徽医科大学基础医学院病理学教研室	2	4	2.0	2.0
4	陈宗科	安徽医科大学基础医学院病理学教研室	4	20	2.0	4.0