用邻位相连法方法确定HIV-1M组基因分型的最佳区域

• 作者: 欧阳龙 聂滨 逯心敏 雷开健
• 来源期刊: 国际检验医学杂志
• 关键词: HIV 基因分型 邻位相连法
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 检验技术与方法
• 页码范围: 463,466
• 页数: 2页
• 字数: 1367字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4130.2014.04.034

摘要

目的 为进一步确定HIV-1M组基因分型的最佳区域.方法 从Genbank中筛选出对各成熟肽区域有注释来源,来自于不同国家地区的104条HIV-1M组全基因组序列.对序列的结构区域gag区、pol区、enV区及env的亚区域gp41和gp120分别建邻位相连(NJ)系统进化树.结果 pol区未能把D亚型和B亚型分开;gag区未把K亚型和F亚型分开;env区能对HIV-1M组正确分型;env的亚区域gp41未能把K亚型与H和F亚型分开,J亚型未与A亚型分开.env的亚区域gp120未能把J亚型与A1亚型分开.结论 用NJ系统进化树方法确定env区最能代表HIV-1M全基因组序列进行分型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	逯心敏		19	73	5.0	8.0
2	聂滨		9	24	3.0	4.0
3	雷开健		6	10	2.0	3.0
4	欧阳龙		1	0	0.0	0.0