用生物信息学方法确定HIV-1M组基因分型的最佳区域

• 作者: 唐昌伟 聂滨 逯心敏 雷开健 鲁卫平
• 来源期刊: 四川医学
• 学科: 医学
• 关键词: HIV 基因型 生物信息学 NJ
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 页码范围: 159-160
• 分类号: Q78|R512.91
• 字数: 1317字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-0501.2011.02.006

摘要

目的 为确定HIV-1M组基因分型的最佳区域.方法 从Genbank中筛选出对各成熟肽区域有注释来源,来自于不同国家地区的104条HIV-1M组全基因组序列.对序列的结构区域gag区,pol区及env区分别建NJ系统进化树.结果 pol区没能把D亚型和B亚型分开;gag区未把K亚型和F亚型分开;env区能对HIV-1M组正确分型.结论 用生物学方法.env区最能代表全基因组序列的分型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	鲁卫平	重庆市大坪医院检验科	2	5	2.0	2.0