鸡新城疫病毒F基因的克隆及序列分析

• 作者: 刘颖 原韬 安琦 平文祥 申燕 葛菁萍 金丽颖 高冬妮
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 新城疫病毒 F基因 RT-PCR 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（26）
• 所属期刊栏目: 兽医—研究报告
• 页码范围: 11-16
• 分类号: Q786
• 语种: 中文

摘要

研究旨在从分子生物学角度研究新城疫病原F基因,探究NDVF基因的遗传变异情况及其蛋白结构.提取新城疫病毒基因组RNA,根据GenBank中已知的NDV La Sota株序列设计引物扩增F基因,将其克隆到pMD18-T载体后进行鉴定,对鉴定正确的重组质粒pMD-NDV-F进行测序分析.应用生物信息学软件对新城疫病毒F基因进行系统进化树分析、氨基酸序列同源性分析、蛋白结构跨膜区分析及F蛋白三级结构的预测.核苷酸序列测定结果表明:F基因为1792 bp,共编码553个氨基酸;生物信息学分析结果表明:F基因在种属间具有较高的保守性,试验获得的F基因与NDV La Sota、Clone30、V4、B1等弱毒株的一致性较高,具有典型的弱毒株特性,F基因的氨基酸序列与新城疫病毒La Sota株F基因的序列同源性最高可达100％;F蛋白的三级结构预测结果显示:F蛋白部分片段与新城疫病毒F蛋白融合片段的相似性为96％.研究为新城疫病毒的分子病毒学研究奠定了基础.