全基因测序法分析肺炎克雷伯菌JM45株对喹诺酮类药物耐药基因

• 作者: 吴康乐 姜如金 孔海深 朱健铭 翁幸鐾
• 来源期刊: 中华医院感染学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肺炎克雷伯菌 泛耐药 全基因组测序 完成图 喹诺酮类
• 年，卷（期）: 2014,（10）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 2341-2344
• 页数: 4页
• 分类号: R378.99+6
• 语种: 中文
• DOI: 10.11816/cn.ni.2014-132331

摘要

目的：分析泛耐药肺炎克雷伯菌JM45株携带的喹诺酮类药物耐药基因，研究其对喹诺酮类药物的耐药机制。方法采用Roche454高通量测序技术对肺炎克雷伯菌JM 45株做全基因组测序（完成图），分析喹诺酮类耐药基因携带状况，再将 gy rA与p arC全长基因与其他6株肺炎克雷伯菌做分子进化分析。结果最终得到JM 45株一条完整的基因组（染色体）序列及两条质粒序列；基因组（染色体）序列大小为5273812 bp （GC含量65．8％），质粒1序列大小为317156 bp（GC含量53．0％），质粒2序列大小为12209 bp（GC含量55．3％）；在基因组（染色体）序列中携带了 gyrA基因（全基因组Feature ID ：KPN_1614），parC基因（Feature ID ：KPN_0743）；与肺炎克雷伯菌喹诺酮类药物敏感株相比较，gyrA基因第83位密码子由 TCC→ATC ，翻译成氨基酸序列后丝氨酸（Ser）→异亮氨酸（Ile），parC基因第80位密码子由AGC→ATC ，翻译成氨基酸序列后丝氨酸（Ser）→异亮氨酸（Ile）。结论肺炎克雷伯菌 JM45株喹诺酮类药物耐药是 gyrA 基因和 parC 基因喹诺酮耐药决定区（QRDR）突变所致；gyrA与 parC全长基因的分子进化分析提示JM45株与肺炎克雷伯菌 HS11286关系最为接近（序列相同），与肺炎克雷伯菌342关系最远。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱健铭	杭州市余杭区中医院检验科	75	570	14.0	18.0
2	姜如金	杭州市余杭区中医院检验科	63	537	13.0	19.0
3	吴康乐	杭州市余杭区中医院检验科	55	436	12.0	17.0
4	孔海深	浙江大学医学院附属第一医院传染病诊治国家重点实验室	64	439	12.0	17.0
5	翁幸鐾	宁波市第一医院检验科	74	555	11.0	20.0