表达谱芯片筛选獭兔毛色相关候选差异表达基因

• 作者: 吴信生 施丽娟 王文洲 秦立志 翁巧琴 闫晓荣
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 獭兔 毛色 差异表达基因 基因芯片
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 568-575
• 页数: 8页
• 分类号: Q81|S829.1
• 字数: 4854字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.04.009

摘要

本研究旨在了解青紫蓝色獭兔和白色獭兔毛色形成的分子遗传学机理.试验分为3组,每组包含全同胞青紫蓝獭兔和白色獭兔各1只.利用安捷伦基因芯片技术分析不同分组之间差异基因表达情况,并通过实时荧光定量PCR方法对部分差异显著基因进行验证.差异表达分析结果显示,3组青紫蓝色獭兔对白色獭兔分别筛选出545、1 680和2 092个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),共有172个共同基因;GO(Gene Ontology)分类结果显示,这些基因主要参与细胞分化、增殖、凋亡、发育、离子转运、免疫应答等生物学过程.通过实时荧光定量PCR技术对Creb1、Wnt、Gnaq和Gna 14基因在组织样中的表达量进行检测,结果与表达谱芯片一致.通过表达谱芯片结果结合生物信息学分析和文献报道,筛选出了Creb1、TH、Wnt、Gnaq、Dvl1、Mapk12等对毛色形成可能具有重要影响的候选基因.