鸡miR-1816前体区单核苷酸多态性(SNP)与鸡经济性状关联分析

• 作者: 孙桂荣 康相涛 王善禾 王顺红 蒋可人
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: MicroRNAs(miRNAs) 单核苷酸多态性(SNP) miRNA加工过程 前体区 关联分析
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1293-1300
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2015.10.004

摘要

MicroRNAs(miRNAs)前体区的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),可能会影响miRNA的加工过程,导致成熟miRNA产量的改变,进而发挥重要的生物学功能.为研究位于miR-1816前体区圆环上的单个SNP rs16057773(A＞G)的遗传效应,并探究该SNP是否影响成熟miR-1816的生成,在固始鸡-安卡鸡(Gallus)F2资源群中,对该SNP与经济性状进行关联分析,该SNP与不同周龄的体重及部分体尺性状包括胫围、体斜长和骨盆宽等性状存在显著相关(P＜0.05),表明该SNP在鸡生长发育过程中扮演重要角色.使用在线软件预测显示,该SNP不影响miRNA二级结构的稳定性.通过进一步构建miR-1816的2种基因型的pcDNA3.1-EGFP表达载体并转染鸡胚成纤维细胞DF1,实时荧光定量PCR(quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)检测显示,不同基因型重组质粒组间成熟miR-1816的表达量相似,表明该SNP不影响miR-1816的加工过程.本研究揭示了位于miR-1816基因前体区上的SNP与鸡的经济性状存在显著的相关性,但该SNP并不影响miR-1816的加工过程,不改变成熟miR-1816的表达水平,说明该SNP不是通过调控自身miRNA的表达量而发挥重要的功能.该研究提示miRNA前体区SNP发挥功能存在不同的途径,有助于对miRNA精细加工过程的理解.