多位点序列分型应用于致病性黄疸出血群钩端螺旋体分析

• 作者: 张翠彩 徐建民 曹志强 李秀文 蒋秀高
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 钩端螺旋体 黄疸出血群 基因分型 MLST
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 395-398
• 页数: 4页
• 分类号: R377
• 字数: 3608字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2015.05.001

摘要

目的 初步探讨MLST(multilocus sequence typing)分型技术在致病性钩端螺旋体中的应用.方法 对我国3个省份的39株致病性钩端螺旋体黄疸出血群菌株提取DNA,采用7个位点进行PCR扩增、序列测定,应用eBURST和BioNumerics (Version5.10)软件进行分析.结果 39株菌株呈现5个ST型别,ST1为中国三省份中主要的基因型,占53.85％(21/39).eBURST分析显示:39株菌株分为2个Clonal complexes和1个singleton,其中Group1占66.67％(26/39),Group2占20.51％(8/39),一个singleton占12.82％ (5/39);BioNumerics软件聚类分析显示:39株菌株分为3个Group,与eBURST分析中的分群结构一致.MLST基因型别具有明显的地域性特征.结论 MLST方法可初步应用于致病性钩端螺旋体分子流行病学、种群结构、亲缘进化关系等研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐建民		14	57	5.0	6.0
2	蒋秀高	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	23	114	5.0	9.0
3	李秀文	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	12	56	5.0	6.0
4	张翠彩	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	11	36	4.0	5.0
5	曹志强	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	3	7	2.0	2.0