猪圆环病毒2型福建分离株ORF2基因遗传变异分析

• 作者: 吴宝成 吴异健 曾显成 林群群 池雪林 谢宝贵 陈景杰
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪圆环病毒2型(PCV2) PMWS ORF2基因 进化树分析
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 预防兽医学
• 页码范围: 1248-1253
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文
• DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2015.08.09

摘要

为了解福建部分地区感染猪圆环病毒2型(PCV2)的基因型及遗传变异情况,采集了9份来自福建4个地区临床疑似PMWS仔猪肺、肾、淋巴结组织,病毒核酸提取后用PCV2ORF2特异引物进行PCR扩增、凝胶电泳,鉴定5份阳性样品,阳性率55.6％,回收、纯化阳性条带后送生物公司测序.Base by Base软件分析发现5份阳性样品ORF2的变异程度很小,主要是1～7个碱基点突变,有1处2个碱基连续突变,没有插入或缺失突变,同源性为98.91％～99.84％.进化树分析显示5份阳性样品都属于Group 1群(PCV2b型)中的1A/1B亚型,表明来自不同地区的样品之间变异较小.结合GenBank中已收录的所有福建18株PCV2ORF2序列进行分析,发现PCV2b基因型占95.6％,其中1A/1B亚型占72.7％,1C亚型占27.3％,结果表明PCV2b基因型中的1A/1B亚型在福建地区广泛流行并占主导地位.研究结果对本地区选择相匹配的疫苗进行有效防控具有重要意义.