草菇耐低温突变菌株Vtlt-1和原始菌株V23转录组差异的研究

• 作者: 于海龙 何建华 吕贝贝 吴潇 李鹏 武国干 王金斌 祝子坪 蒋玮
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 草菇 表达谱芯片 耐低温 KEGG代谢通路分析
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1143-1152
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.140110

摘要

为了培育草菇耐低温菌株与解析其耐低温的分子机制,采用紫外诱变的方法,选育出耐低温草菇菌株Vtlt-1,并利用表达谱芯片技术,比较突变菌株Vtlt-1与原始菌株V23的表达差异基因,筛选差异显著基因后利用GO(gene ontology)功能注释和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集等方法分析,结果发现与V23相比Vtlt-1表达显著差异基因共有1 600个,其中704个基因上调表达,896个基因下调表达.针对差异基因的GO功能分类结果发现:生物学过程方面,差异基因主要分布在金属离子结合、氧化还原过程、碳水化合物的代谢与核酸的结合.细胞组分方面主要与细胞核相关;分子功能中,氧化还原活性以及解旋酶活性,依赖于ATP的解旋酶活性、DNA指导的RNA聚合酶活性.KEGG注释结果发现差异表达基因主要富集在氨基酸与氮类物质的代谢、脂肪酸与生物碱的合成这两方面,此外还富集到核糖体的生物合成、细胞色素P450、RNA聚合酶、硫和氨基酸的代谢、核酸的修复等通路.这些结果为解析草菇耐低温机制提供分子依据和理论基础.