烟草脉带花叶病毒基因组序列分析

• 作者: 张剑锋 李锋 王忠 王燃 蔡联合 谢小东 陈媛媛 魏攀 魏春阳
• 来源期刊: 中国烟草学报
• 关键词: 烟草脉带花叶病毒 保守基序 序列分析 进化分析 重组分析
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 113-120
• 页数: 8页
• 字数: 4087字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16472/j.chinatobacco.2015.008

摘要

为了探明烟草脉带花叶病毒危害和流行的机制,使用RT-PCR技术扩增获得TVBMV云南分离物YN9.1基因组全序列,并进行了基因组结构、序列同源性、氨基酸保守基序、系统进化和重组分析.结果表明:(1) YN9.1基因组具有Potyvirus属病毒典型特征,含有在Potyvirus属病毒中较为少见的NIb/CP切割位点Q/N;(2) YN9.1与其它分离物核苷酸序列同源性为90.5-91.1％,氨基酸序列同源性为95.2-96.2％.与YND核苷酸和氨基酸序列同源性最高;(3)对HC-Pro和CP保守基序进行了分析.YN9.1具有RITC、PTK、DAG等病毒蚜虫传播保守基序,其中RITC在Potyvirus属病毒中常见形式为KITC;(4)系统进化树分析结果显示,TVBMV进化形成2个组,云南分离物独立进化形成一组,TVBMV进化与地域具有明显的相关性;(5)重组分析发现PY为ZC1和YN的组内重组体,重组位点位于HC-Pr0 3'末端和NIb 5'端.