番茄HDACs家族基因在胁迫条件下的表达分析

• 作者: 徐小万 李植良 李涛 李颖 王恒明 苏慧慧 黎振兴
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 组蛋白去乙酰化酶 表达分析 氧化胁迫 青枯病
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 1994-2001
• 页数: 8页
• 分类号: S641.2
• 字数: 4960字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2015.11.012

摘要

组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases,HDACs)家族基因在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用.利用生物信息学方法对番茄的HDACs家族成员、分布及结构和功能等进行分析.结果表明,番茄HDACs家族包含15个成员,分为3个亚家族.遗传进化分析表明,番茄HDACs家族成员与拟南芥HDACs家族具有相似分类.利用实时荧光定量PCR对番茄HDACs家族基因的组织表达分析表明,HDACs具有组织特异性表达差异,SlHDT1、SlHDT2和S1HDT3在根中表达较高,而SlHDA1、S1H DA3、SlHDA5、SlHDA6在果实发育过程中表达较高;利用RT-PCR对番茄HDACs的胁迫响应分析表明,在盐、SA、ABA、高温和低温胁迫条件下,15个番茄HDACs成员的表达模式不同,其中部分基因的表达水平被显著地诱导增加或者降低,推测这些基因很可能参与了调控番茄逆境胁迫条件下的防御应答反应.结果将为进一步解析番茄HDACs家族基因的功能奠定基础.