番茄GRX基因家族的鉴定及表达分析

• 作者: 李植良 李涛 王永飞 苏慧慧 黎振兴
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 番茄 GRX基因家族 生物信息学 表达分析
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 663-673
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2015.04.0663

摘要

GRX基因家族是从原核生物到真核生物中普遍存在的一类巯基-二硫键氧化还原酶,在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中均发挥重要作用.本研究在番茄基因组范围内,利用生物信息学方法对番茄的GRX基因组家族的成员、分布及结构和功能等进行分析.预测结果显示,番茄GRX家族包含55个蛋白质,分为4个亚族,其中植物特有的CC亚族成员最多,有35个,其他GRX基因成员与拟南芥GRX家族具有相似分类.在番茄GRX结构域中包含12个重要的基序,主要分布在序列的N端,相同亚族中的GRX成员蛋白序列的氨基酸保守域构成基本一致,且各亚族成员的氨基酸保守域组成特异,表明这些基序的存在对GRX蛋白功能的执行是必需的.利用实时荧光定量PCR对番茄GRX基因的组织表达和胁迫响应分析,结果表明,GRX基因具有组织特异性表达差异,CC型在根和花中表达较高,在果实中表达较低;在盐、SA、ABA、高温和低温胁迫条件下,22个番茄GRX基因的表达模式被阐明;其中部分基因的表达水平被显著地诱导增加或者降低,很可能参与了调控番茄逆境胁迫条件下的防御应答反应.本研究结果将为番茄GRX家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析GRX基因功能奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王永飞	暨南大学生命科学技术学院	108	770	17.0	22.0
2	黎振兴	广东省农业科学院蔬菜研究所	45	392	9.0	18.0
3	李植良	广东省农业科学院蔬菜研究所	45	451	11.0	19.0
4	李涛	广东省农业科学院蔬菜研究所	21	79	5.0	8.0
5	苏慧慧	暨南大学生命科学技术学院	4	20	3.0	4.0