谷子OFP基因家族的鉴定及表达分析

• 作者: 李娜 李珊 段明 郭昱 韩渊怀 马芳芳
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: OFP基因家族 谷子 抗旱 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 467-476
• 页数: 10页
• 分类号: S515
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2020.04.01

摘要

谷子是我国重要的粮饲作物,具有抗旱耐贫瘠的特点,OFP家族是植物特有的一类调节植物生长和发育的转录因子,参与调控植物的抗逆性.为了探索谷子OFP家族基因的特征和功能,通过基因定位、基因结构分析、motif预测、进化分析与顺式作用元件分析及亚细胞定位预测来解析谷子OFP家族基因的特征,分析谷子与拟南芥和水稻基因组中的OFP家族基因的共线性、选择压力,最后分析谷子OFP家族基因的表达模式.结果表明,共筛选到谷子OFP家族基因34个,分布在8条染色体上;进化分析发现,谷子OFP家族基因可以分为3个亚类;motif预测中共鉴定到8个motif基序;顺式作用元件分析发现,与干旱响应相关的OFP基因共22个;与拟南芥的5个基因、水稻的31个基因存在共线性;18个OFP家族基因被预测定位到细胞核内;谷子OFP家族基因在穗中表达量最多,干旱胁迫下的OFP基因大多表现下调,具有时空特异性.OFP家族基因Seita.2G184300、Seita.7G093000、Seita.3G008900的表达差异可能是造成豫谷1号和安-04抗旱性差异较大的原因之一.结果可为谷子OFP家族基因的功能研究提供基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李娜	山西农业大学农学院	40	125	7.0	9.0
2	郭昱	山西农业大学农学院	3	6	1.0	2.0
3	李珊	山西农业大学农学院	1	0	0.0	0.0