谷子XTH基因家族与抗旱相关基因的分析

• 作者: 元香梅 张凯烨 武雪 王军 禾璐 韩渊怀 马芳芳
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 谷子 XTH 耐旱基因 功能预测
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种与栽培
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: S515
• 语种: 中文

摘要

[目的]木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH)属于糖苷水解酶GH16家族,其家族成员可能在植物响应逆境胁迫的过程中发挥重要作用,为深入挖掘谷子抗旱基因,进而选育谷子抗逆新品种,[方法]本研究利用生物信息学手段,对谷子XTH基因家族进行了分析.[结果]从谷子基因组数据库中鉴定出16个XTH基因.结构分析表明:SiXTH家族成员在基因结构及编码区序列上较为保守,含1～3个内含子;谷子XTH蛋白含有XTH家族典型的保守基序DEIDFEFLG;预测SiXTH基因家族成员在启动子区域含有响应逆境胁迫的顺式作用元件.在干旱胁迫下,通过比较两个谷子品种勾勾母鸡咀及晋汾16在干旱胁迫下基因的相对表达水平,我们发现了3个上调表达和1个下调表达的SiXTH基因.[结论]因此推测,同一类基因其基因结构及蛋白结构域相似,且XTH基因家族在谷子应答干旱胁迫的过程中起一定的作用,同时本研究也为深入探究XTH基因家族成员的功能奠定了一定的基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马芳芳	山西农业大学农学院	8	23	3.0	4.0
2	禾璐	山西农业大学农学院	3	7	1.0	2.0
3	元香梅	山西农业大学农学院	4	9	2.0	3.0
4	张凯烨	山西农业大学农学院	1	6	1.0	1.0
5	武雪	山西农业大学农学院	1	6	1.0	1.0