谷子ABC转运蛋白基因与抗旱关系的研究

• 作者: 于世慧 刘晓东 张瑞杰 李红英 王喆 连卜颖 郭展 魏东
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 谷子 ABC转运蛋白 抗旱性 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 专栏:谷子抗旱分子机制
• 页码范围: 11-15
• 页数: 5页
• 分类号: S515|Q94
• 语种: 中文
• DOI: 10.13842/j.cnki.issn1671-8151.201709030

摘要

[目的]ABC转运蛋白是一类广泛存在于生物体中最古老的蛋白家族,在植物的生长发育及抗逆胁迫中发挥着重要作用.本文旨在探究ABC转运蛋白基因与谷子抗旱性的关系,挖掘谷子抗旱基因,并为谷子抗旱分子机制的研究提供理论依据.[方法]以谷子抗旱品种勾勾母鸡咀(GG)和干旱敏感品种晋汾16(JF16)为研究材料,在苗期对二者用20% PEG胁迫处理,并取其叶片进行转录组测序,筛选出4个与ABC转运蛋白相关的差异表达基因.用生物信息学方法分析基因的基本信息、启动子顺式元件,并构建ABC抗逆相关基因的系统进化树以及对ABC转运蛋白基因进行表达模式分析.[结果]发现谷子ABC转运蛋白基因等电点范围在6.81~8.97之间,分子量范围在51195.75~161579.13 Da;启动子中包含有许多响应胁迫的功能元件(ABA、Ethylene、GA、MeJA、Light、MYB、SA、热和低温响应元件等);在进化树分析中发现,Seita.1G039400.1和 Seita.7G176000.1亲缘关系最近,其次与 A tA BCC5亲缘关系较近;经过干旱处理,只有 Seita.7G176000.1基因在抗旱品种中表达增加,其余3个基因在抗旱品种中表达均降低.[结论]Seita. 7G176000.1基因可能通过调节气孔开闭参与植物抗逆,进而调控谷子响应干旱胁迫,初步推测其为谷子ABC基因家族抗旱候选基因,为进一步研究ABC转运蛋白基因与植物抗逆性关系提供理论依据.