谷子抗旱相关蛋白激酶基因家族鉴定及表达分析

• 作者: 李红英 李雪垠 樊武哲 武懿茂
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 谷子 干旱 蛋白激酶 基因家族 生物信息学 基因表达
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 作物
• 页码范围: 1-10
• 页数: 10页
• 分类号: S515
• 语种: 中文
• DOI: 10.13842/j.cnkii.ssn1671-8151.201905008

摘要

[目的]蛋白激酶是一类催化蛋白质磷酸化反应的酶,普遍存在于植物体中,参与调控植物生长发育和抗逆等多种生理反应.本文旨在探究谷子响应干旱胁迫与蛋白激酶之间的关系,为谷子抗旱品种的培育提供参考.[方法]运用生物信息学方法,分析了谷子蛋白激酶基因家族的35个抗旱相关蛋白激酶基因的系统进化关系、基因结构、保守基序、保守结构域、启动子顺式元件以及在干旱处理下和不同组织中基因表达水平.[结果]这35个谷子抗旱相关蛋白激酶基因分布于8条染色体上,被分为4个亚家族;多数亲缘关系较近的基因,其外显子-内含子结构、保守基序、保守结构域也较为相似,它们可能具有功能上的相似性;启动子元件分析发现,多数基因启动子区含有ABA响应元件(ABRE)和干旱诱导响应元件(MBS);组织特异性表达发现,SiPK20和SiPK25基因表现出显著的组织特异性表达模式,SiPK20在叶中表达量较高,SiPK25在根中表达量较高;干旱诱导基因表达分析显示,在抗旱品种勾勾母鸡咀中,干旱处理后SiPK1和SiPK4基因表达量显著上升,并且SiPK1、SiPK4启动子区域都含有较多的MBS元件,说明SiPK1和SiPK4极有可能参与谷子干旱胁迫响应,并且SiPK4在根中表达量较高.[结论]SiPK4可能通过调控谷子根部发育参与根部对干旱胁迫的应答反应,可作为抗旱相关的候选基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	武懿茂	山西农业大学农学院	6	5	1.0	2.0
2	樊武哲	山西农业大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0
3	李红英	山西农业大学农学院	10	19	3.0	4.0
4	李雪垠	山西农业大学生命科学学院	5	1	1.0	1.0