二穗短柄草钙依赖型蛋白激酶基因 BdCDPK14克隆及表达分析

• 作者: 何光源 杨广笑 赵旭东 韦淑亚
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 二穗短柄草 BdCDPK14基因 克隆 生物信息学分析 干旱胁迫 表达
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 761-767
• 页数: 7页
• 分类号: Q949.714.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2017.05.001

摘要

[目的]克隆分析二穗短柄草钙依赖型蛋白激酶(CDPK)基因BdCDPK14,并检测其在干旱胁迫下的表达量,为揭示钙依赖型蛋白激酶的抗旱调控机制打下基础.[方法]根据NCBI检索结果设计特异引物,以二穗短柄草cDNA为模板,采用PCR扩增二穗短柄草CDPK基因家族成员BdCDPK14,利用在线分析软件对BdCDPK14基因编码蛋白进行生物信息学分析,并采用RT-PCR检测PEG-6000干旱胁迫下的BdCDPK14基因表达量.[结果]从二穗短柄草叶片中克隆获得的BdCDPK14基因(GenBank登录号XM_003564390)片段长度1750 bp,其开放阅读框(ORF)1545 bp,编码514个氨基酸,其编码蛋白分子量56.78 kD,理论等电点5.45,脂肪指数78.21,不稳定指数38.66,属于稳定蛋白.BdCDPK14蛋白与小麦TaCPK13蛋白(ABY59018)的亲缘关系最近,含有4个EF-hands结构、蛋白酪氨酸激酶结构域、脂多糖激酶家族、ATP结合区域、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶激活区和预测跨膜区等结构域,主要由无规卷曲和α-螺旋构成,位于叶绿体和细胞质膜上.在PEG-6000干旱胁迫下,BdCDPK14基因在胁迫3 h内的相对表达量无明显变化,胁迫6 h后相对表达量开始升高,至胁迫12 h时的相对表达量最高.[结论]克隆获得的BdCDPK14基因为二穗短柄草CDPK基因家族成员之一,参与其抗干旱胁迫反应,可作为候选基因用于二穗短柄草抗旱机制研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韦淑亚	武汉职业技术学院生物工程学院	8	8	2.0	2.0