蒺藜苜蓿cation/H+exchanger基因家族鉴定及表达特征分析

• 作者: 吴彤 刘云苗 金军 董伟峰 才晓溪 孙明哲 贾博为 孙晓丽
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: 蒺藜苜蓿 阳离子质子转运体 CHX 生物信息学
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 181-194
• 页数: 13页
• 语种: 中文
• DOI: 10. 11686/cyxb2021237

摘要

CPA(cation proton antiporter)超家族通过转运质子和一价金属离子调节细胞内离子和 pH 稳定。阳离子质子转运体(cation/H+ exchanger，CHX)基因家族属于CPA2(cation proton antiporter 2)超家族，其N端有一个Na+/H+exchanger 结构域，对植物维持细胞离子平衡、花器官发育起着至关重要的作用。通过生物信息学手段，系统地分析了蒺藜苜蓿CHX家族基因，通过全基因组筛选共鉴定出47个MtCHXs；染色体定位分析表明蒺藜苜蓿CHX基因分布在8条不同的染色体上；同源性分析显示蒺藜苜蓿和拟南芥亲缘关系近，而与水稻亲缘关系远；进一步进化关系分析将47个MtCHXs 基因分为5组，并且各组内成员在基因结构和基序上比较保守；顺式作用元件分析发现MtCHXs 基因启动子包含大量光响应元件、激素响应元件以及干旱、低温、创伤响应元件；表达特性分析发现MtCHXs在生殖器官中高表达，并且响应干旱、低温等非生物胁迫。