珠三角地区鸭坦布苏病毒的全基因序列测定与分析

• 作者: 刘湘红 刘金 张克山 张靖鹏 王林川 蔡丝丝 陈瑞爱 陈芳艳
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭坦布苏病毒 克隆测序 全基因组序列 囊膜蛋白毒力位点 鸭黄病毒
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 页码范围: 13-19
• 页数: 7页
• 分类号: S855.3
• 字数: 3709字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2015.03.003

摘要

[目的]了解2010年以来分离于珠三角地区鸭坦布苏病毒病(Duck Tembusu virus,DTMUV) GDNS2010.1、GDNS2010.2、GDZQ2012、GDPY2013株的分子特征.[方法]参考GenBank收藏的DTMUV JS804株,共设计合成11对特异性引物,扩增了4株病毒的全基因序列片段.[结果和结论]4株病毒全长约为10 990 bp,无Ploy(A)尾结构,仅含有1个大的ORF,共编码3 426个氨基酸,5 '非编码区(5'UTR)各含有94 bp.在3'非编码区(3'UTR),GDNS2010.1、GDNS2010.2毒株在103 395～103 411 bp处缺失10个碱基.联合前期试验已测定的2株病毒序列(GDHZ2012.1、GDHZ2012.2),用DNAstar和MEGA6.0序列分析软件将6株病毒同GenBank收藏的国内的其他坦布苏病毒株比对,发现核酸序列相似性在98％以上,与Ntaya病毒和Sitiawan病毒相似性较大,相似性都在73％左右;与西尼罗河病毒、日本乙型脑炎病毒、黄热病毒等相似性皆低于63％.6株病毒囊膜蛋白E核酸序列相似性为97.5％ ～99.9％,推导氨基酸序列相似性在97％以上,其中同一地区分离的毒株相似性最高,达99.9％;在囊膜蛋白E154位存在一潜在的糖基化位点Asn-Try-Ser,在E蛋白结构域Ⅱ第E289位,极性带正电荷的Lys变为极性带负电荷的Glu,推测这一位点可能为病毒的毒力位点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈芳艳	华南农业大学动物科学学院	114	521	11.0	16.0
2	刘金	华南农业大学兽医学院	5	13	2.0	3.0
3	张克山	华南农业大学兽医学院	3	11	2.0	3.0
4	蔡丝丝	华南农业大学兽医学院	4	7	2.0	2.0
5	刘湘红	华南农业大学兽医学院	1	0	0.0	0.0
6	张靖鹏	华南农业大学兽医学院	2	5	1.0	2.0