菲律宾蛤仔RP2基因的克隆及组织表达分析

• 作者: 李霞 杨艳津 王福景 秦艳杰 裴爱君 赵祥吉 闫喜武
• 来源期刊: 大连海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 菲律宾蛤仔 视网膜色素变性基因2 分子克隆 组织表达分析
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 页码范围: 132-137
• 页数: 6页
• 分类号: S917.4
• 字数: 5328字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/J.ISSN.2095-1388.2015.02.004

摘要

采用反转录PCR(RT-PCR)与cDNA末端快速克隆(RACE)法首次从壳长为28 mm的菲律宾蛤仔Ruditapes philippinarum外套膜中克隆出RP2 基因(GenBank登录号: KF826881).结果表明: RP2 基因cDNA序列长度为1158 bp, 包括62 bp的5′端非编码区, 41 bp的3′端非编码区, 开放阅读框1053 bp, 编码350个氨基酸; 推导的氨基酸序列具有TBCC(57aa~175aa)和CARP(65aa~102aa)保守结构域, 并为非跨膜糖蛋白; 经Blast同源性比较表明, 菲律宾蛤仔RP2氨基酸序列与太平洋牡蛎Crassostrea gigas的相似性较高(56%), 与高等哺乳动物、 鸟类、 鱼类、 两栖类和节肢动物各模式动物之间的相似性为43% ~53%, 与非洲眼线虫Loa loa的相似性较低(33%); 利用实时定量PCR技术检测RP2基因在菲律宾蛤仔不同组织中的表达, 结果显示, RP2基因在菲律宾蛤仔雄性性腺中表达量最高, 在鳃、 水管和外套膜组织中次之, 在斧足和闭壳肌中表达量极少, 在雌性性腺中无表达.研究表明, RP2基因在菲律宾蛤仔各组织中的表达较为广泛, 但不同组织的表达量存在明显差异, 本研究结果可为无脊椎动物RP2基因的结构及其功能研究提供基础数据.