REP、RAPD和PFGE方法在志贺菌分子分型中的应用评价

• 作者: 孙玉国 苑广盈 边锋芝 郑秀峰 闻新棉 马全萍
• 来源期刊: 中国卫生检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 志贺菌 分子分型 分子流行病学
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 分子诊断与基因检测
• 页码范围: 548-550,554
• 页数: 4页
• 分类号: R378.2+5
• 语种: 中文

摘要

目的 探索一种简便、准确、快速的分子分型方法用于志贺菌传染源的追溯和调查.方法 采用细菌基因组重复序列(REP)、随机扩增多态性分析(RAPD)、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分别对62株志贺菌进行分子分型,根据分型结果比较3种方法的优点与不足.结果 REP仅分出A、B2个型,RAPD可分出A、B、C、D、E、F6个型,53株福氏志贺菌共分5个PFGE带型,9株宋内志贺菌为1个型,包括3个亚型.结论 REP用于相似度较高的菌株分辨效果较差,不适用于区域内菌株的分型;PFGE分型准确度高,但操作繁琐、时间较长;RAPD分型虽与PFGE分型有所差异,但分辨效果较好,且操作简便、价格低廉.RAPD可用于细菌性痢疾暴发事件的分子流行病学调查.