DNA提取方法对桑树内生菌多样性研究的影响

• 作者: 万幸 张韧 邝枣园 马嫚 黄雅丽
• 来源期刊: 广州中医药大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 桑树/分离和提纯 内生菌 DNA提取 PCR-DGGE
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 729-734
• 页数: 6页
• 分类号: R284.2
• 字数: 5636字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13359/j.cnki.gzxbtcm.2015.04.033

摘要

【目的】基于聚合酶链式反应—变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）对桑树根、茎、叶组织内生菌多样性的分析，结合浓度、纯度、 PCR扩增性等指标，比较4种DNA提取方法之优劣。【方法】采用常见的DNA提取方法十六烷基三甲基溴化铵（CTAB）法、缓冲液振荡（SPBS）法、液氮研磨（LNG）法和试剂盒（KIT）法提取桑树各组织DNA,从PCR-DGGE多样性等多方面对4种方法进行比较。【结果】对于桑树根和茎， DNA提取浓度最高的方法是LNG法，最低的是SPBS法；桑树叶情况则完全相反。桑树各组织， KIT法获得的DNA纯度均最高。桑树各组织通过16S rDNA PCR-DGGE比较内生细菌多样性，适宜的DNA提取方法是LNG法或CTAB法，不宜采用KIT法提取DNA。内生真菌ITS PCR-DGGE分析结果完全不同，最佳提取方法是KIT法，最不适宜的DNA提取方法因组织不同而异。【结论】对于桑树内生菌研究，最佳的DNA提取方法因组织不同而异，还与研究的内生菌种类有关系。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邝枣园	广州中医药大学基础医学院	96	1268	23.0	31.0
2	黄雅丽	广州中医药大学基础医学院	15	46	4.0	6.0
3	张韧	广州中医药大学基础医学院	32	120	7.0	10.0
4	万幸	广州中医药大学基础医学院	20	274	7.0	16.0
5	马嫚	江西医学高等专科学校基础医学院	5	4	1.0	2.0