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摘要:
目的:了解我国不同来源非O157产志贺毒素大肠埃希菌( Shiga toxin-producing Esche-richia coli, STEC)分离株携带的eae基因型别。方法 PCR扩增eae全长基因,扩增产物经测序并拼接后在美国国立生物技术信息中心( NCBI)中进行BLASTn比对,判定其eae基因型别,并与GenBank中已公布的30种 eae 不同型别的序列及产志贺毒素大肠埃希菌主要流行血清型( O157∶H7, O26∶H11, O103∶H2, O111∶H8, O145∶H28, O45∶H2, O121∶H19)代表性基因组测序菌株的eae序列用Neighbor-Joining法构建系统发生树,分析其进化关系。根据mlst.ucc.ie数据库提供的大肠埃希菌多位点序列分型( multilocus sequence typing, MLST)方案对菌株进行MLST分型分析,确定菌株等位基因型及序列类型,并用BioNumerics软件构建最小生成树( minimum spanning tree, MST),分析携带eae基因的非O157 STEC分离株与溶血性尿毒综合征相关大肠埃希菌( HUS-associated en-terohemorrhagic E.coli,HUSEC)、E.coli MLST数据库中所有人源流行血清群O26、O103、O111、O121、O145、O157 STEC菌株的进化关系。结果10株不同来源的非O157产志贺毒素大肠埃希菌分离株经扩增拼接后均获得了约2.8 kb的eae基因全长序列,分为3种已知的eae基因型别,其中以β1型为主(6/10),2株θ型,2株γ1型。某些eae序列与主要流行血清型STEC的eae序列完全一致。10株菌分为7个ST型,与HUSEC、人源流行血清群STEC菌株具有相近的进化关系。结论我国非O157产志贺毒素大肠埃希菌分离株eae基因存在一定程度的多样性,eae阳性菌株具有潜在的高致病性。
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文献信息
篇名 非 O157产志贺毒素大肠埃希菌分离株eae 基因分型分析
来源期刊 中华微生物学和免疫学杂志 学科
关键词 非O157产志贺毒素大肠埃希菌 eae基因 MLST 分型
年,卷(期) 2015,(6) 所属期刊栏目 细菌学
研究方向 页码范围 414-418
页数 5页 分类号
字数 4183字 语种 中文
DOI 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2015.06.003
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中华微生物学和免疫学杂志
月刊
0254-5101
11-2309/R
大16开
北京市经济技术开发区经海二路38号
2-55
1981
chi
出版文献量(篇)
5865
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10
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26456
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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