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非 O157产志贺毒素大肠埃希菌分离株eae 基因分型分析
非 O157产志贺毒素大肠埃希菌分离株eae 基因分型分析
作者:
周娟
熊衍文
白向宁
许彦梅
赵爱兰
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
非O157产志贺毒素大肠埃希菌
eae基因
MLST
分型
摘要:
目的:了解我国不同来源非O157产志贺毒素大肠埃希菌( Shiga toxin-producing Esche-richia coli, STEC)分离株携带的eae基因型别。方法 PCR扩增eae全长基因,扩增产物经测序并拼接后在美国国立生物技术信息中心( NCBI)中进行BLASTn比对,判定其eae基因型别,并与GenBank中已公布的30种 eae 不同型别的序列及产志贺毒素大肠埃希菌主要流行血清型( O157∶H7, O26∶H11, O103∶H2, O111∶H8, O145∶H28, O45∶H2, O121∶H19)代表性基因组测序菌株的eae序列用Neighbor-Joining法构建系统发生树,分析其进化关系。根据mlst.ucc.ie数据库提供的大肠埃希菌多位点序列分型( multilocus sequence typing, MLST)方案对菌株进行MLST分型分析,确定菌株等位基因型及序列类型,并用BioNumerics软件构建最小生成树( minimum spanning tree, MST),分析携带eae基因的非O157 STEC分离株与溶血性尿毒综合征相关大肠埃希菌( HUS-associated en-terohemorrhagic E.coli,HUSEC)、E.coli MLST数据库中所有人源流行血清群O26、O103、O111、O121、O145、O157 STEC菌株的进化关系。结果10株不同来源的非O157产志贺毒素大肠埃希菌分离株经扩增拼接后均获得了约2.8 kb的eae基因全长序列,分为3种已知的eae基因型别,其中以β1型为主(6/10),2株θ型,2株γ1型。某些eae序列与主要流行血清型STEC的eae序列完全一致。10株菌分为7个ST型,与HUSEC、人源流行血清群STEC菌株具有相近的进化关系。结论我国非O157产志贺毒素大肠埃希菌分离株eae基因存在一定程度的多样性,eae阳性菌株具有潜在的高致病性。
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非O157产志贺毒素大肠埃希菌研究进展
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大肠埃希菌O157∶H7
志贺毒素
非O157产志贺毒素大肠杆菌分离株的多位点序列分型研究
非O157产志贺毒素大肠杆菌
多位点序列分型
序列型
内容分析
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内容分析
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文献信息
篇名
非 O157产志贺毒素大肠埃希菌分离株eae 基因分型分析
来源期刊
中华微生物学和免疫学杂志
学科
关键词
非O157产志贺毒素大肠埃希菌
eae基因
MLST
分型
年,卷(期)
2015,(6)
所属期刊栏目
细菌学
研究方向
页码范围
414-418
页数
5页
分类号
字数
4183字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2015.06.003
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(36)
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(19)
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引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
非O157产志贺毒素大肠埃希菌
eae基因
MLST
分型
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华微生物学和免疫学杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0254-5101
CN:
11-2309/R
开本:
大16开
出版地:
北京市经济技术开发区经海二路38号
邮发代号:
2-55
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
5865
总下载数(次)
10
总被引数(次)
26456
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
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