新疆3个不同品种牛SLC11A1基因启动子克隆及序列分析

• 作者: 叶锋 易新萍 谷文喜 钟旗 马晓菁
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 牛 SLC11A1基因 启动子 差异
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 页码范围: 2103-2110
• 页数: 8页
• 分类号: S823|S188
• 字数: 5542字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2015.11.021

摘要

[目的]溶质性载体蛋白家族成员1(SLC11A1)基因是一个主要的自然抗性候选基因,与多种胞内寄生病原菌的抵抗作用相关,研究克隆新疆褐牛、荷斯坦牛和西门塔尔牛SLC11 A1基因启动子序列,分析启动子序列差异,为奶牛抗病育种提供辅助选择的分子标记.[方法]分别采集新疆3个品种牛全血,提取基因组DNA,PCR扩增5'端启动子区,测序.利用生物信息学软件CpGplot、RepeatMasker、TFSEARCH、WWW SignalScan及双荧光素酶检测系统对获得序列进行分析.[结果]获得SLC11A1基因启动子片段1 463 bp,且具有启动子活性,未发现CpG岛的存在.新疆3个品种牛间SLC11A1基因启动子序列未出现差异,但与美国安格斯牛SLC11A1基因启动子序列存在4处差异.启动子区预测到SP1,NF1,RelA-p65,GKLF,CPBP等12个转录因子结合位点,并发现1个增强子区域(-734～-740),该序列存在两处短散的重复元件BOV-tA2、MIR3,以及重复DNA元件Charlie8.[结论]得到新疆地区3个品种牛SLC11A1基因启动子序列,并与安格斯牛SLC11A1基因启动子序列存在差异,为进一步研究SLC11A1基因多态性影响机体对胞内感染菌的抗性研究提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟旗	新疆畜牧科学院兽医研究所	33	327	10.0	17.0
2	易新萍	新疆畜牧科学院兽医研究所	19	62	4.0	7.0
3	叶锋	新疆畜牧科学院兽医研究所	18	61	4.0	7.0
4	谷文喜	新疆畜牧科学院兽医研究所	28	281	9.0	16.0
5	马晓菁	新疆畜牧科学院兽医研究所	15	34	3.0	5.0