基于LDA模型和MDS算法的多基因组可视化

• 作者: 王亚东 隽立然
• 来源期刊: 智能计算机与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 可视化 多基因组 LDA模型 MDS算法
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 页码范围: 36-38,42
• 页数: 4页
• 分类号: TP18
• 字数: 4223字
• 语种: 中文

摘要

面向多基因组的研究,以建模多个体关系和比较个体差异为主要研究内容.多基因组可视化可以帮助研究者依据多个体关系,有目的地分析、比较多基因组之间的差异.多个基因组遗传变异层面的比较,因为变异数量巨大、并且绝大部分变异并无信息性,故而很难在有限的显示空间内可视化.本文根据多基因组可视化的需求,分析了多基因组可视化的数据降维策略,提出了基于LDA模型及KL散度的多基因组相似度求解方法,建立了基于MDS算法的多基因组可视化降维方法,并使用千人基因组第三阶段的基因组变异数据,验证上述方法的可靠性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王亚东	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院	92	1036	16.0	29.0
2	隽立然	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院	1	1	1.0	1.0