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丹参病程相关蛋白基因PR10的克隆与表达分析
丹参病程相关蛋白基因PR10的克隆与表达分析
作者:
王志霜
申业
赵乐
郑晓珂
马利刚
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
丹参
病程相关蛋白
生物信息学分析
原核表达
条件优化
摘要:
病程相关蛋白(PR)的产生与积累是植物体应对生物或非生物胁迫的主要特征之一.该研究以人工培养的丹参幼苗为材料,通过分析丹参转录组数据,根据丹参病程相关蛋白基因PR10的序列设计特异性引物,采用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)从丹参中获得PR10基因的开放阅读框(ORF),命名为SmPR10-1(GenBank注册号KF877034),并进行原核表达和纯化.结果表明:(1)SmPR10-1基因ORF为477 bp,编码158个氨基酸,其蛋白质分子质量为17.38 kD.(2)通过蛋白结构预测、序列多重比对和构建进化树等生物信息学分析,发现SmPR10-1基因具有保守序列(G-X-G-G-X G)和(K-A-X-E-X-Y),其编码蛋白与葡萄等双子叶植物中的PR10蛋白同源性较高.(3)经异丙基β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导,含有表达载体pET32a-SmPR10-1的大肠杆菌(Escherichia coli-BL21)可诱导表达融合蛋白;对影响蛋白表达的4个因素优化结果表明,SmPR10-1蛋白的最佳表达条件为:IPTG终浓度0.4 mmol/L、起始宿主菌密度A600为0.8、诱导温度30℃、诱导时间8h,并得到纯化的SmPR10-1蛋白.该结果为进一步研究SmPR1 0-1基因在丹参抗病方面的生物学功能和培育丹参抗病品种奠定了基础.
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文献信息
篇名
丹参病程相关蛋白基因PR10的克隆与表达分析
来源期刊
西北植物学报
学科
生物学
关键词
丹参
病程相关蛋白
生物信息学分析
原核表达
条件优化
年,卷(期)
2015,(6)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
1078-1084
页数
7页
分类号
Q785|Q786
字数
5927字
语种
中文
DOI
10.7606/j.issn.1000-4025.2015.06.1078
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
郑晓珂
河南中医学院药学院
177
2007
27.0
38.0
2
赵乐
河南中医学院药学院
45
96
6.0
8.0
3
马利刚
河南中医学院药学院
34
65
5.0
6.0
4
申业
中国中医科学院中药资源中心
13
66
5.0
7.0
5
王志霜
中国中医科学院中药资源中心
1
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研究主题发展历程
节点文献
丹参
病程相关蛋白
生物信息学分析
原核表达
条件优化
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
西北植物学报
主办单位:
西北农林科技大学
陕西省植物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-4025
CN:
61-1091/Q
开本:
大16开
出版地:
陕西省杨陵邰城路3号西北农林科技大学
邮发代号:
52-73
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
7739
总下载数(次)
9
总被引数(次)
145271
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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西北植物学报2015年第9期
西北植物学报2015年第8期
西北植物学报2015年第7期
西北植物学报2015年第6期
西北植物学报2015年第5期
西北植物学报2015年第4期
西北植物学报2015年第3期
西北植物学报2015年第2期
西北植物学报2015年第12期
西北植物学报2015年第11期
西北植物学报2015年第10期
西北植物学报2015年第1期
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