E.tenella河北株EtMIC-2基因克隆及生物信息分析

• 作者: 丁咚 刘铮铸 张文香 张艳英 张香斋 李佩国 李蕴玉 贾青辉
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 柔嫩艾美耳球虫 微线蛋白-2 克隆 序列分析 蛋白结构预测
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 预防兽医学
• 页码范围: 1079-1083,1111
• 分类号: S852.72
• 语种: 中文
• DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2015.07.10

摘要

利用RT-PCR技术扩增出柔嫩艾美耳球虫(E.tenella)河北株EtMIC-2基因,将该基因克隆入pMD19-T载体,进行测序、序列分析与蛋白结构预测.测序显示该基因全长为1 029 bp,含有1个1 029 bp开放阅读框(ORF),编码342个氨基酸.该基因与E.tenella杂交株(ZJ)、北京株(BJ)、广东株(GD)、豪顿株(HD)、GenBank上发表的EtMIC-2基因以及布氏艾美耳球虫的MIC-2基因核苷酸序列同源性分别为99.1％、99.7％、99.6％、99.6％、99.8％和40.6％;与其基因编码的氨基酸序列同源性分别为97.7％、99.1％、98.8％、99.1％、99.4％和38.5％.蛋白结构预测显示该蛋白相对分子质量为35 000,理论等电点PI为4.47,包括4 893个原子,分子式C1500 H2429N431-O528-S5,丝氨酸(Ser)在20种氨基酸中所占的比例最高,达12.0％,稳定系数为42.19,脂肪系数为77.05;信号肽的位置为前22个氨基酸;空间结构具有17个α螺旋,19个β折叠,15个转角,24处无规则卷曲;只有1个较强疏水位点(大约在第8～11氨基酸处),没有跨膜区域.