利用目标基因捕获结合第二代测序技术发现腹主动脉瘤致病基因突变

• 作者: 李小燕 杜杰 王绿娅 蔡伦 郭俊
• 来源期刊: 中国动脉硬化杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 腹主动脉瘤 原纤维蛋白1 目标基因捕获 第二代测序
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 153-155
• 分类号: R5
• 语种: 中文

摘要

目的 建立目标基因捕获结合第二代测序技术对腹主动脉瘤患者原纤维蛋白1(FBN1)基因进行突变筛查,探讨腹主动脉瘤与FBN1基因突变的关系.方法 提取4例腹主动脉瘤患者外周血全基因组DNA,利用GenCap目标基因捕获技术,设计FBN1的65个外显子区域特异性捕获探针,与基因组DNA文库进行杂交,将目标基因组区域的DNA片段进行富集后,再利用Illumina HiSeq2000第二代测序仪进行测序,通过数据分析,确定突变位点,用Sanger测序法对突变位点进行验证.结果 设计合成的目标基因特异性捕获探针可有效地捕捉并富集基因组DNA的目标靶片段.4例患者目标区域平均测序深度为448.15～536.61,99.5％ ～ 99.7％目标区域覆盖度.经过数据分析及Sanger测序验证发现1个新的错义突变c.2753 C＞G(p.Pro918 Arg),dbSNP137数据库、千人基因组及内部800名正常汉族人数据库均无此突变.经SIFT预测为有害突变.结论 本研究所建立的GenCap目标基因捕获技术结合Illumina HiSeq2000第二代测序技术成功地发现了FBN1的新突变.该方法快速而有效,对腹主动脉瘤分子病因学有更好的认识.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王绿娅	首都医科大学附属北京安贞医院北京市心肺血管疾病研究所心血管重塑相关疾病教育部重点实验室	83	376	11.0	15.0
2	郭俊	首都医科大学附属北京安贞医院北京市心肺血管疾病研究所心血管重塑相关疾病教育部重点实验室	3	7	1.0	2.0
3	蔡伦	首都医科大学附属北京安贞医院北京市心肺血管疾病研究所心血管重塑相关疾病教育部重点实验室	4	3	1.0	1.0
4	李小燕	首都医科大学附属北京安贞医院北京市心肺血管疾病研究所心血管重塑相关疾病教育部重点实验室	3	1	1.0	1.0