水稻半纤维素支链合酶基因GT61家族的结构特征和组织表达分析

• 作者: 张冉 彭良才 易晓燕 李丰成 李旭凯 王友梅 谢国生 郭凯
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 半纤维素 OsGT61基因家族 结构特征 基因表达
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 页码范围: 19-28
• 分类号: Q341|S511
• 语种: 中文
• DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2015.01.03

摘要

从生物信息学和基因表达的角度,鉴定OsGT61家族成员的结构特征和组织表达特性.结果表明,OsGT61家族含有25个成员,分为3个亚类.A、B和C亚类分别含有19、3和3个成员,其基因的外显子数介于1～7个.其蛋白质大小为49.1～73.8 ku,pI为5.4～10.4.该家族蛋白质的C端motif较为保守.而且,它们含有Ser/Thr激酶的磷酸化位点分别为9～29个和3～13个,Tyr激酶的磷酸化位点小于7个.但是,该家族成员的糖基化位点相对较少,16个成员存在1～4个O糖基化位点,3个蛋白存在1～2个N糖基化位点.基因表达芯片聚类分析和半定量RT-PCR检测表明,OsGT61基因家族主要成员在不同组织中表达水平存在明显差异.这些结果暗示OsGT61家族基因在水稻不同组织中细胞壁半纤维素生物合成中发挥不同作用.