2012-2013年湖北省麻疹病毒流行株核蛋白N基因和血凝素蛋白H基因特征分析

• 作者: 占建波 张婷 李国明 李静 杨朝晖 雷亚克
• 来源期刊: 中华疾病控制杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 麻疹病毒 核蛋白 血凝素蛋白 基因进化
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 760-764
• 分类号: R511.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2015.08.002

摘要

目的 分析近年湖北省麻疹病毒流行株基因型别以及血凝素蛋白(H)基因特性.方法 对2012-2013年麻疹病毒核酸检测阳性的患者标本,直接提取核酸,采用one-step逆转录一聚合酶链反应方法扩增核蛋白(N)和血凝素蛋白(H)基因,测序后进行同源性和进化分析.结果 湖北省麻疹病毒流行株主要为H1基因型的H1a亚型,发现一株D8基因亚型.与中国麻疹疫苗株上海191株的N和H基因比较,其核苷酸同源性分别为91.6％～92.4％和94.6％～94.8％.对湖北省H1a亚型麻疹病毒H基因进化分析发现均属lineage 3b,H蛋白序列分析发现第240和第397位氨基酸分别发生Ser→Asn、Pro→Leu的变异.运用贝叶斯中的马尔科夫链的蒙特卡洛方法,估计H1a基因亚型H基因核苷酸的平均碱基替代率为7.619×10-4取代/位点/年,估算其共同祖先大约出现在1980年.结论 湖北省2012-2013年麻疹病毒流行株主要H1a基因型,仅1例D8亚型;与中国疫苗株沪191株相比较,两者在基因特性上存在明显差异,需进一步加强对麻疹病毒基因型别和变异程度的监测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李国明	湖北省疾病预防控制中心传染病防治研究所病原微生物检测中心	41	220	8.0	12.0
2	李静	湖北省疾病预防控制中心传染病防治研究所病原微生物检测中心	22	91	6.0	8.0
3	雷亚克	湖北省疾病预防控制中心传染病防治研究所病原微生物检测中心	13	56	5.0	7.0
4	杨朝晖	湖北省疾病预防控制中心传染病防治研究所病原微生物检测中心	8	43	5.0	6.0
5	张婷	湖北省疾病预防控制中心传染病防治研究所病原微生物检测中心	11	48	5.0	6.0