高通量测序分析胆囊结石患者microRNA表达谱差异

• 作者: 刘斌 吴韬 张捷 杨斌 王强
• 来源期刊: 天津医药
• 关键词: 微RNAs 基因表达谱 序列分析 胆囊结石病 差异表达 高通量测序 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 细胞与分子生物学
• 页码范围: 348-352
• 页数: 5页
• 分类号: R657.4+2|R318.04
• 语种: 中文
• DOI: 10.11958/j.issn.0253-9896.2015.04.004

摘要

目的：探讨胆囊结石和非结石患者胆囊黏膜中miRNA表达谱的差异。方法选取30例胆结石患者（结石组）和30例胆囊息肉患者（非结石组）的胆囊黏膜组织，采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术进行深度测序，比较2组的microRNA表达差异。对差异表达的miRNAs进行筛选与靶基因预测，并进行GO和KEGG功能显著性富集分析。荧光定量RT-PCR（qRT-PCR）对差异表达miRNAs进行验证。结果结石组和非结石组分别获得2215832和1424770条序列，平均长度22 nt。2组间显著差异表达的miRNA共计17个，其中9个表达上调，8个表达下调。GO分析结果示靶基因富集于离子的结合和转运、载脂蛋白结合、钙离子通道激活、蛋白激酶活性等分子功能以及大分子的合成和代谢、类固醇激素生物合成和代谢等生物进程。KEGG通路富集分析示靶基因多集中于癌症相关通路，包括WNT、Hippo等信号通路。qRT-PCR结果示差异性miRNA的表达趋势与测序结果相一致。结论差异表达的miRNA可能在胆囊结石的形成中具有重要作用。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张捷	昆明医科大学第二附属医院肝胆外科	11	30	3.0	5.0