新疆杏品种(系)遗传多样性分析及DNA指纹图谱库构建

• 作者: 刘娟 刘欢 孙琪 廖康 曼苏尔·那斯尔 贾杨
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 新疆杏品种(系) 遗传多样性 DNA指纹图谱库
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 748-758
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2015.04.12

摘要

[目的]从ISSR分子标记水平分析新疆主栽杏品种(系)的遗传多样性和亲缘关系,构建新疆杏品种(系)的DNA指纹图谱数据库,为杂交育种、品种鉴定和品种分类提供理论依据.[方法]从供试样品中选取表型差异较大的6份材料对100个ISSR引物进行筛选,最终筛选出条带清晰、主带明显、多态性丰富、能够稳定重复且对品种具有较高鉴别力的ISSR特征引物,对48个新疆杏品种(系)进行扩增,采用POPGENE version 1.32软件计算多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei,s多样性指数(H)和Shannon信息指数(1),及各材料间的Nei's遗传相似系数(GS)和遗传距离(GD),并利用NTSYS pc version2.10e软件根据Nei's遗传相似系数采用UPGMA方法进行聚类,以此分析遗传多样性和亲缘关系;利用4个引物特异位点的不同组合及Ge12.0指纹图谱自动识别系统鉴别48个新疆主栽杏品种(系),并利用Ge12.0构建主栽杏品种(系)的DNA指纹图谱库.[结果]从100个ISSR引物中筛选到重复性好、多态性丰富的4个引物作为特征引物,分别为UBC809、UBC836、UBC844和UBC850,共扩增出78个位点,其中73个为多态性位点,平均多态性位点百分率为93.13％,其中引物UBC844多态性位点百分率最高,为100.00％;48个新疆主栽杏品种(系)的观测等位基因数、有效等位基因数、Nei's基因多样性和Shannon信息指数的平均值分别为1.9313、1.4368、0.2622和0.4028,说明各品种(系)的遗传多样性相对较丰富.‘黄肉油杏’和‘大五月杏’的遗传相似系数为0.8846,遗传距离为0.1226;‘库曼提’和‘索格佳娜丽’的遗传相似系数为0.5641,遗传距离为0.5725.将4个引物两两组合起来,可快速、准确地鉴别46个杏品种(系),只有‘辣椒杏’和‘伊犁阿克玉吕克’需要3个引物组合才能鉴别出来,利用这4个ISSR特征引物通过Ge12.0指纹图谱自动识别系统构建了48个杏品种(系)的DNA标准指纹图谱数据库.[结论]新疆主栽杏品种(系)的遗传多样性较丰富,亲缘关系相对较近,‘黄肉油杏’和‘大五月杏’的亲缘关系最近,‘库曼提’和‘索格佳娜丽’的亲缘关系最远;且ISSR标记适于新疆主栽杏品种的遗传多样性、亲缘关系分析及构建DNA指纹图谱库;指纹图谱库的建立为杏品种(系)的鉴定及品种真实性和纯度奠定了基础,为新品种登记、注册和品种知识产权保护等提供科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	廖康	新疆农业大学特色果树研究中心	228	2421	25.0	35.0
2	刘娟	新疆农业大学特色果树研究中心	45	344	10.0	15.0
3	贾杨	新疆农业大学特色果树研究中心	22	131	7.0	10.0
4	刘欢	新疆农业大学特色果树研究中心	21	179	7.0	12.0
5	孙琪	新疆农业大学特色果树研究中心	26	215	9.0	13.0
6	曼苏尔·那斯尔	新疆农业大学特色果树研究中心	17	96	6.0	9.0