新余市HIV-1流行毒株基因分型及其流行特征分析

• 作者: 刘芳宇 晏火兰 毛尚根 潘虹
• 来源期刊: 中国卫生检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 人免疫缺陷病毒1型 基因亚型 序列分析 流行病学
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 分子诊断与基因检测
• 页码范围: 1229-1231
• 页数: 3页
• 分类号: R512.91
• 语种: 中文

摘要

目的 了解新余市HIV-1的流行亚型、遗传多样性及其分子流行病学特征,为艾滋病的治疗与预防提供实验室数据.方法 随机收集49份血清抗-HIV阳性者的血浆标本并提取RNA,逆转录为模版DNA后采用巢式PCR法扩增基因env及gag,并对扩增产物进行测序,Blast比对确定基因亚型,构建系统进化树,分析其流行病学特征.结果 49份标本中,扩增出env及gag基因片段18份(36.73％),共发现2种基因型,其中CRF01-AE亚型16份(88.89％)、CRF07-BC亚型2份(11.11％).两基因构建的系统进化树高度一致,主要是CRF01-AE、CRF07-BC流行.结论 新余市至少有2种HIV-1基因亚型在流行,都为重组型,其中CRF01-AE为主要亚型.新余市应更加重视HIV-1基因亚型和变异的监测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘虹		17	10	2.0	3.0
2	毛尚根		10	7	1.0	2.0
3	刘芳宇		8	9	2.0	3.0
4	晏火兰		6	0	0.0	0.0