成脂调控网络(ARN)数据库的分析和预测功能

• 作者: 昝林森 王力 黄艳
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 肥胖 成脂 调控网络 数据库 大数据
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 研究资源与技术改进
• 页码范围: 1790-1800
• 分类号: S188|Q756
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2016.11.017

摘要

脂肪组织中脂类的过量积累会导致肥胖,进而引发心血管疾病、二型糖尿病和其他疾病.成脂是指干细胞分化为能够积聚脂滴的脂肪细胞的过程,受到一个复杂且高度协调的基因表达网络的调节,为促进成脂调控中关键基因和通路的发现,探索脂肪生成的分子调控机理,在之前的研究中,本实验室通过对成脂相关文献进行文本挖掘构建出一个包含3万多条成脂相关数据和信息的成脂调控网络(Adipogenesis Regulation Network,ARN)数据库(http://210.27.80.93/arn/).为了进一步充分发掘ARN数据库促进成脂相关研究的潜在价值,本研究通过“开放的”和“闭合的”两种构建假说的原理,设计出能够用于分析成脂分化相关试验数据或构建科学假说的在线分析工具-ARN-analysis.另外,通过对成脂调控网络中各节点(基因和小分子RNA)的互作关系数、差异表达记录数和互作关系预测数进行统计分析,计算得到体现各节点重要性的节点影响值(impact factor,IF).最后,通过对成脂调控网络中各节点的互作关系进行统计分析和作图,探索了成脂调控网络的拓扑结构.结果显示,ARN数据库的分析工具能够有效分析“节点相关”、“表达相关”及“用户录入”3类数据,帮助科研人员分析试验数据或构建科学假说.节点的IF值能够帮助科研人员快速识别重要的节点或假说,对调控网络拓扑结构的分析能加深对成脂调控机理的认识.本研究对成脂专业数据库的分析和预测功能的探索,为专业研究人员分析数据和构建假说提供了新的途径,探索了运用过去积累的大量科研数据促进未来的科研实践的可能性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	昝林森	西北农林科技大学动物科技学院	292	2090	23.0	31.0
2	王力	西北农林科技大学动物科技学院	37	560	13.0	23.0
3	黄艳	西北农林科技大学动物科技学院	3	0	0.0	0.0