多种信息融合的细胞凋亡蛋白质的亚细胞定位预测

• 作者: 翟媛媛 薛济先 陈颖丽
• 来源期刊: 计算生物学
• 学科: 医学
• 关键词: 细胞凋亡蛋白 MRNA二级结构 亚细胞定位
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 页码范围: 62-71
• 页数: 10页
• 分类号: R73

摘要

研究表明mRNA的序列和结构特性与蛋白质的亚细胞定位有一定关系。本文提取了细胞凋亡蛋白质的两种mRNA信息:三阅读框3-mer mRNA序列频数信息、mRNA二级结构-序列模式信息,并结合细胞凋亡蛋白质的氨基酸物理化学性质、氨基酸黏性特征和进化信息,构成特征向量来表示mRNA和蛋白质序列,利用支持向量机算法,对四种不同亚细胞位置的细胞凋亡蛋白质进行预测。研究发现融合mRNA信息与氨基酸信息后预测效果更佳,在Jackknife检验下,预测总精度达到82.18%,且独立测试集预测总精度达到78.26%。结果表明,mRNA的序列和结构特性有助于细胞凋亡蛋白质的亚细胞定位预测。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈颖丽	内蒙古大学物理科学与技术学院	14	69	5.0	8.0
2	薛济先	内蒙古大学物理科学与技术学院	4	0	0.0	0.0
3	翟媛媛	内蒙古大学物理科学与技术学院	2	0	0.0	0.0