南海短尾大眼鲷线粒体Cyt b基因序列及种群判别分析

• 作者: 张魁 李敏 李永振 李玉芳 熊丹 陈作志
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 种群判别 短尾大眼鲷 细胞色素b 南海
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 188-197
• 页数: 10页
• 分类号: S931
• 字数: 4786字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2016.15114

摘要

对采集于中国南海北部近岸和南沙西南部陆架海域7个采样点共246尾短尾大眼鲷(Priacanthus macracanthus)样品进行了线粒体细胞色素b基因(cytochrome b,cyt b)序列的扩增与分析,获得了长度为684 bp的同源序列.碱基A、T、C、G含量分别为22.7％、28.4％、33.4％、15.5％,共检测到多态位点92个,定义了90个单倍型.其遗传多样性表现出高单倍型多样性(0.8130～0.9012)和低核苷酸多样性(0.0040～0.0053)的特点.两两群体间的Fst分析显示,大部分群体间的Fst值均小于0.05,且差异不显著(P＞0.05),样本总体分化指数仅为0.012,群体间分化程度很低.分子方差分析(AMOVA)表明,群体间的遗传变异仅占总遗传变异的1.25％,98.75％的遗传变异源于群体内,群体之间有较高的遗传同质性.基于邻接法构建的系统发育树和基于中间连接法构建的单倍型网络图均显示,南海短尾大眼鲷不存在与地理群体对应的支系,遗传分化不显著.中性检测和不对称分布分析发现,南海短尾大眼鲷群体在更新世晚期发生过种群扩张.结果表明南海短尾大眼鲷群体间的遗传交流较频繁,可以认为是一个大的种群.