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TGIF1在红细胞分化中的功能和机制研究
TGIF1在红细胞分化中的功能和机制研究
作者:
刘淑阁
张昭军
方向东
李艳明
郑佳文
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
红系分化
TGIF1
转录因子
转录组测序
摘要:
目的 筛选潜在的促红系分化因子,并验证其对红系分化的促进作用,探讨促分化机制.方法 首先通过对高通量组学测序数据的分析,找到潜在红系调控转录因子;之后在红系分化的细胞模型TF-1细胞系中干扰该因子的表达,观察该因子的异常表达对红系分化的影响;进一步对目的基因敲低的细胞系进行转录组测序,同时利用生物信息学的手段分析受影响的红系相关因子以及通路.结果 高通量组学测序分析得到潜在促红系分化调控因子TGIF1.TGIF1敲低细胞中,ε-珠蛋白、γ-珠蛋白、红系特异转录因子(GATA1、KLF1)、以及红系细胞表面特异糖蛋白标志分子CD235a的mRNA表达量及血红蛋白浓度均低于对照组.TGIF1过表达细胞的 γ-珠蛋白mRNA高于对照组;促红细胞生成素诱导3天后,TGIF1过表达细胞表面CD235a的表达高于空白细胞组.进一步对稳定敲低TGIF1的TF-1细胞系进行高通量转录组测序分析,发现Smad复合物和相关靶基因表达上调,而GATA1和ALAS2的表达量则降低.结论 TGIF1是一个促红系分化的转录调控因子,可能通过影响转化生长因子 β(transforming growth factor-β,TGFβ)通路中Smad复合物和相关靶基因的表达,或通过影响GATA1和ALAS2的表达来调控红系分化过程.
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篇名
TGIF1在红细胞分化中的功能和机制研究
来源期刊
发育医学电子杂志
学科
关键词
红系分化
TGIF1
转录因子
转录组测序
年,卷(期)
2016,(4)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
211-217
页数
7页
分类号
字数
5142字
语种
中文
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发育医学电子杂志
主办单位:
人民卫生出版社
出版周期:
季刊
ISSN:
2095-5340
CN:
11-9335/R
开本:
16开
出版地:
北京市东城区朝内北小街2号
邮发代号:
创刊时间:
2013
语种:
chi
出版文献量(篇)
584
总下载数(次)
3
总被引数(次)
892
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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