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摘要:
目的 筛选潜在的促红系分化因子,并验证其对红系分化的促进作用,探讨促分化机制.方法 首先通过对高通量组学测序数据的分析,找到潜在红系调控转录因子;之后在红系分化的细胞模型TF-1细胞系中干扰该因子的表达,观察该因子的异常表达对红系分化的影响;进一步对目的基因敲低的细胞系进行转录组测序,同时利用生物信息学的手段分析受影响的红系相关因子以及通路.结果 高通量组学测序分析得到潜在促红系分化调控因子TGIF1.TGIF1敲低细胞中,ε-珠蛋白、γ-珠蛋白、红系特异转录因子(GATA1、KLF1)、以及红系细胞表面特异糖蛋白标志分子CD235a的mRNA表达量及血红蛋白浓度均低于对照组.TGIF1过表达细胞的 γ-珠蛋白mRNA高于对照组;促红细胞生成素诱导3天后,TGIF1过表达细胞表面CD235a的表达高于空白细胞组.进一步对稳定敲低TGIF1的TF-1细胞系进行高通量转录组测序分析,发现Smad复合物和相关靶基因表达上调,而GATA1和ALAS2的表达量则降低.结论 TGIF1是一个促红系分化的转录调控因子,可能通过影响转化生长因子 β(transforming growth factor-β,TGFβ)通路中Smad复合物和相关靶基因的表达,或通过影响GATA1和ALAS2的表达来调控红系分化过程.
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篇名 TGIF1在红细胞分化中的功能和机制研究
来源期刊 发育医学电子杂志 学科
关键词 红系分化 TGIF1 转录因子 转录组测序
年,卷(期) 2016,(4) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 211-217
页数 7页 分类号
字数 5142字 语种 中文
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期刊影响力
发育医学电子杂志
季刊
2095-5340
11-9335/R
16开
北京市东城区朝内北小街2号
2013
chi
出版文献量(篇)
584
总下载数(次)
3
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892
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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