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南方型紫花苜蓿苗期叶片盐胁迫差异蛋白分析
南方型紫花苜蓿苗期叶片盐胁迫差异蛋白分析
作者:
张振亚
裴翠明
马进
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
紫花苜蓿
盐胁迫
差异蛋白
同位素相对标记与绝对定量技术(iTRAQ)
摘要:
以南方型紫花苜蓿(Medicago sativa ‘Millennium’)30 d苗龄的实生苗为实验材料,分析正常培养和250 mmol/L NaC1处理72 h后叶片中的蛋白表达变化,以期从蛋白质水平上揭示南方型紫花苜蓿适应盐胁迫的分子机制.采用同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)结合双向液相色谱与串联质谱(2-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry,2D-LC-MS/MS)定量蛋白质组技术鉴定南方型紫花苜蓿叶片响应盐胁迫的差异表达蛋白,对所获得差异蛋白进行生物信息学分析,筛选出可能的耐盐潜在靶标蛋白.结果表明,共鉴定3 712个定量蛋白,417个表达量有显著差异的蛋白质(变化倍数≥1.2,P≤0.05),其中包含291个表达上调的蛋白,126个表达下调的蛋白.按照基因本体(Gene Ontology,GO)分类体系,对差异蛋白归类分析,揭示其亚细胞定位和分子功能.京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路显著性富集于代谢途径、次生代谢产物生物合成、吞噬体、脂肪酸代谢和光合作用等(P<0.05,错误发现率(false discovery rate,FDR)<0.05).成功鉴定的差异蛋白分别涉及到光合作用(7%)、信号传递(3%)、防御(2%)、碳水化合物代谢(11%)、氨基酸代谢(7%)、脂类代谢(5%)、其它代谢(7%)、蛋白质合成、加工与降解(18%)、细胞结构、分裂和细胞骨架(3%)、抗氧化物(6%)、能量产生与转运(7%)、膜和胞内运输(7%)及未知功能蛋白类(16%).差异表达蛋白中与抗氧化物、能量产生与转运、防御和信号传递及代谢等相关的蛋白表达量总体上调,而与蛋白质合成、加工与降解和光合途径相关蛋白表达量总体下调.研究发现,细胞色素P450、PSⅡ放氧增强蛋白、磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C、果糖-1,6-二磷酸醛缩酶、甘露糖-6-磷酸还原酶、海藻糖-6-磷酸合酶、天冬氨酸转氨酶、E3泛素连接酶和H+-ATP酶C亚基蛋白等可能是紫花苜蓿耐盐潜在靶标蛋白.采用iTRAQ结合2D-LC-MS/MS技术,能有效地筛选出南方型紫花苜蓿叶片响应盐胁迫差异表达蛋白,这些差异表达蛋白可能在紫花苜蓿耐盐调控过程中发挥重要作用,该研究为深入认识紫花苜蓿盐胁迫的应答分子调控机制提供理论依据.
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关联
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生长参数
叶片
盐胁迫
代谢组学
内容分析
文献信息
引文网络
相关学者/机构
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期刊文献
内容分析
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关键词热度
相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
南方型紫花苜蓿苗期叶片盐胁迫差异蛋白分析
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
紫花苜蓿
盐胁迫
差异蛋白
同位素相对标记与绝对定量技术(iTRAQ)
年,卷(期)
2016,(11)
所属期刊栏目
研究论文与报告
研究方向
页码范围
1629-1642
页数
分类号
S722.3
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2016.11.001
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
马进
浙江农林大学风景园林与建筑学院
29
162
8.0
11.0
2
裴翠明
浙江农林大学风景园林与建筑学院
9
54
5.0
7.0
3
张振亚
浙江农林大学风景园林与建筑学院
8
49
5.0
7.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
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参考文献
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节点文献
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同被引文献
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二级引证文献
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二级引证文献(0)
2018(3)
引证文献(1)
二级引证文献(2)
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引证文献(3)
二级引证文献(5)
研究主题发展历程
节点文献
紫花苜蓿
盐胁迫
差异蛋白
同位素相对标记与绝对定量技术(iTRAQ)
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
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总下载数(次)
8
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