基于高通量测序技术分析患病与健康虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)闭壳肌菌群多样性

• 作者: 丁君 刘圣聪 张涛 窦妍 赵晓伟
• 来源期刊: 生态学杂志
• 关键词: 虾夷扇贝 变形菌门 微生物多样性 高通量测序
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 页码范围: 1019-1025
• 语种: 中文
• DOI: 10.13292/j.1000-4890.201604.034

摘要

本研究取自同一养殖海域不同浮筏养殖笼中健康和患脓包病虾夷扇贝(Patino-pecten yessoensis)样品,健康虾夷扇贝样品标记为CK,患病样品分别标记为S1、S2和S3,使用MiSeq高通量测序技术比较不同生存状态的虾夷扇贝的微生物组成与差异.结果表明:4个样品中菌群多样性表现为S3＞CK＞S1 ＞S2;4个样品中的细菌可归为24个门,主要门类有变形菌门、拟杆菌门、浮霉菌门、梭杆菌门、厚壁菌门、酸杆菌门、放线菌门、硝化螺旋菌门、绿菌门和绿弯菌门;在健康虾夷扇贝样品中,变形菌门占绝对优势,占整个菌群的95.9％,患病虾夷扇贝样品中,S1和S3中优势类群均为变形菌门,分别占整个菌群的80.4％和86.8％,S2中优势菌群为拟杆菌门,占56.9％.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	丁君	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室	47	394	13.0	17.0
2	张涛		9	38	3.0	6.0
3	刘圣聪		9	94	3.0	9.0
4	窦妍	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室	6	79	6.0	6.0
5	赵晓伟	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室	3	47	3.0	3.0