水貂IGF-1R基因SNPs筛查及其与生长性状的关联分析

• 作者: 宋兴超 宋姗姗 杨福合 王雷 邢秀梅
• 来源期刊: 吉林农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 银蓝水貂 美国短毛黑水貂 IGF-1R基因 遗传标记 生长性状
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 页码范围: 350-356
• 分类号: S865.22|Q78
• 语种: 中文
• DOI: 10.13327/j.jjlau.2015.2779

摘要

为分析IGF-1R基因部分SNPs与银蓝水貂与美国短毛黑水貂2个群体生长性状的关联性.以同龄同场的银蓝水貂和美国短毛黑水貂为研究对象,采用PCR产物直接测序法筛查IGF-1R基因CDS序列的多态位点,利用SPSS(19.0)软件GLM统计模型分析基因SNPs不同基因型与水貂生长性状的相关性.在线软件对IGF-1R基因进行生物信息学分析.结果表明:在IGF-1R基因外显子2和外显子8分别检测到G207A同义突变和G1782A同义突变,根据测序峰图对2位点进行基因分型.群体遗传学分析显示,G207A位点在银蓝水貂群体中属于低度多态,G1782A位点在银蓝水貂群体中属于中度多态,G207A和G1782A 2个位点在美国短毛黑水貂中均为中度多态;x2检验表明,银蓝水貂和美国短毛黑水貂群体在2个突变位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05);关联分析表明,G1782A位点与美国短毛黑水貂的体重显著相关(P＜0.05),突变纯合子AA基因型个体的体重值显著高于GG基因型个体和GA基因型个体.因此G1782A位点适合于短毛黑水貂体重的分子标记选择.