沙田柚WRKY转录因子的克隆与序列分析

• 作者: 刘玉洁 张渝 李惠敏 秦新民 覃信梅 郭丹妮 韩愈
• 来源期刊: 广西师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 沙田柚 WRKY 转录因子 自交不亲和性
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 页码范围: 131-137
• 页数: 7页
• 分类号: Q946
• 字数: 2785字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16088/j.issn.1001-6600.2016.03.019

摘要

利用高通量测序技术对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序,差异分析得到沙田柚 WRKY 转录因子的序列.该基因的全长序列为1178 bp (GenBank accession No．KU173833),含有993 bp的开放阅读框(ORF)可编码330个氨基酸,编码蛋白的相对分子质量为37．00 ku,理论等电点为5．79.与未授粉的花柱相比,沙田柚异花授粉1、2、3 d花柱中 WRKY转录因子基因的表达量(RPKM)分别为5．67、26．04、17．08；而自花授粉1、2、3 d花柱中 WRKY转录因子基因的表达量(RPKM)分别为15．67、14．96、3．89.氨基酸序列分析表明,该氨基酸序列与甜橙、金桔的同源性分别为98％、97％.系统进化分析发现沙田柚 WRKY转录因子与甜橙、金桔的亲缘关系很近,属于一个分支.