基于16S rDNA宏基因组学技术探究未知病因足部溃烂的致病因素

• 作者: 刘文丽 王伟 童贻刚 米志强 舒鹏
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 16S rDNA 宏基因组学 未知病因
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 318-321,361
• 页数: 5页
• 分类号: Q789|Q811.4
• 字数: 3130字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2016.03.004

摘要

目的:探究未知病因足部溃烂病人的致病因素.方法:收集10例未知病因足部溃烂病人样品,提取细菌总DNA,基于16S rDNA宏基因组学技术,测序16S rDNA基因V1～V2高变区,借助生物信息学方法分析测序数据中的菌群结构,寻找病人足部溃烂可能的致病因素.结果:10份样品共产生原始测序数据260 Mbp,优势菌门包括变形菌门、拟杆菌门、厚壁菌门、放线菌门、蓝菌门和梭杆菌门,不同样品间菌群分布有差异;同时,在属水平上统计了10份样品中均出现的细菌,其中一些与伤口的慢性感染和溃疡有关,如葡萄球菌属和链球菌属在所有样本中平均含量分别达5.37％和2.16％.结论:足部溃烂病人伤口含丰富细菌基因组,发现了伤口溃疡有关细菌线索,为揭示疾病的发生和发展提供帮助.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	童贻刚	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	58	363	11.0	17.0
2	王伟	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	17	65	5.0	7.0
3	刘文丽	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	3	2	1.0	1.0
4	舒鹏	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	2	1	1.0	1.0
5	米志强	军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室	13	57	4.0	7.0