基于RNA-Seq筛选禽致病性大肠杆菌损伤雏鸡小肠差异表达基因

• 作者: 刘红梅 周秀红 李少参 涂健 王惠珂 祁克宗 薛挺
• 来源期刊: 中国预防兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 禽致病性大肠杆菌 雏鸡小肠 转录组测序 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 病原生物学
• 页码范围: 111-115
• 页数: 5页
• 分类号: S852.61
• 字数: 3983字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0589.2016.02.06

摘要

为筛选禽致病性大肠杆菌(APEC)感染雏鸡后其小肠损伤的差异表达基因,本研究利用APEC菌株经腿部肌肉途径接种两周龄雏鸡,对照组鸡以相同的途径注射相同体积的生理盐水,选取病变严重的肠道与对照组肠道,利用高通量RNA-Seq技术筛选出雏鸡小肠受APEC损伤后的差异表达基因,对其进行生物信息学GO功能分类和KEGG信号通路分析,并利用荧光定量PCR验证部分差异表达基因.结果显示差异变化在2倍以上的基因共有131个,其中74个上调表达,57个下调表达.GO功能分类结果显示,这些基因主要涉及到蛋白结合、免疫反应、转运活动等功能.KEGG分析表明这些差异表达基因参与PPAR、新陈代谢、细胞因子受体相互作用、Jak-STAT、RIG-I-样受体、吞噬体等信号通路.本研究为进一步研究APEC的致病作用及宿主抗病机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘红梅	安徽农业大学动物科技学院	36	105	5.0	8.0
2	祁克宗	安徽农业大学动物科技学院	172	1178	18.0	24.0
3	周秀红	安徽农业大学动物科技学院	21	103	7.0	9.0
4	涂健	安徽农业大学动物科技学院	71	391	11.0	16.0
5	薛挺	安徽农业大学动物科技学院	8	22	3.0	4.0
6	王惠珂	安徽农业大学动物科技学院	5	16	2.0	4.0
7	李少参	安徽农业大学动物科技学院	3	12	2.0	3.0