HIV-1逆转录酶的分子对接及运动功能相关性分析

• 作者: 刘嵬 左柯 杜文义 梁立 胡建平 苟小军
• 来源期刊: 原子与分子物理学报
• 学科: 化学
• 关键词: HIV-1逆转录酶 高斯网络模型 各向异性网络模型 分子对接 新药设计
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 原子、分子结构与光谱
• 页码范围: 963-972
• 页数: 10页
• 分类号: O64
• 字数: 4829字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0364.2016.12.002

摘要

目的：研究逆转录酶的运动性和生理功能的关系,以及N-乙酰基-β-芳基-1,2-二脱氢乙胺类衍生化合物与其的分子识别,方法采用高斯网络模型和各向异性网络模型研究了p66和p66-DNA的运动模式差异,并用分子对接方法研究化合物与逆转录酶的识别。结果 DNA的结合对p66各区域的运动方向影响不大,但其运动的幅度大大降低。分子对接结果发现Y115和M184的疏水结构在识别的过程中起到重要作用。结论基于各个区域的运动方向分析,推测手指区和RNase H区的开合运动可能是逆转录酶发挥逆转录功能的重要原因。并且,N-乙酰基-β-芳基-1,2-二脱氢乙胺类衍生化合物的N-甲基取代和反式的双键结构更有利于与逆转录酶的识别。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苟小军	成都大学药食同源植物资源开发重点实验室	98	1342	17.0	33.0
2	刘嵬	成都大学药食同源植物资源开发重点实验室	25	379	6.0	19.0
3	胡建平	成都大学药食同源植物资源开发重点实验室	37	122	7.0	9.0
5	杜文义	成都大学药食同源植物资源开发重点实验室	3	3	1.0	1.0
6	梁立	成都大学药食同源植物资源开发重点实验室	15	42	3.0	6.0
7	左柯	成都大学药食同源植物资源开发重点实验室	4	4	1.0	1.0