sRP技术在微量蛋白质组学分析中的应用

• 作者: 冷文川 刘明伟 徐建明 杨帅 秦钧
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 高pH反相色谱微柱(sRP)技术 预分离 质谱 蛋白质组学
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 228-232,262
• 页数: 6页
• 分类号: Q503
• 字数: 4827字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2016.02.019

摘要

目的:发展一种适用于微量临床样本的简单而高效的预分离方法,实现深度覆盖蛋白质组学分析的目的.方法:以H1975细胞系和胃黏膜活检组织等复杂样本为研究对象,比较基于高pH反相色谱微柱(sRP)技术在不同浓度梯度洗脱时的蛋白鉴定数目、蛋白定性与定量研究的重复性及不同组分间的肽段预分离效果,并将sRP技术初步运用到微量胃黏膜活检组织的蛋白质组学分析中,进一步注释鉴定的胃黏膜蛋白的生物学功能.结果:单个复杂样本蛋白鉴定的覆盖深度达到7500左右,时间缩短到8h之内;在生物学重复性研究中,蛋白定性检测的重复率在90％以上,无标定量检测的相关系数R2则达到0.97;各组分之间的肽段预分离效果很好,最大的重复率也只有11.6％;在胃黏膜组学分析中,累积鉴定到9000多个非冗余蛋白,实现了对人类胃黏膜蛋白质组的深度覆盖.结论:sRP技术操作简单且重复性好,联合高通量质谱技术,实现了对微量临床样品的深度覆盖蛋白质组学分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐建明		8	79	4.0	8.0
2	杨帅		1	0	0.0	0.0
3	刘明伟	北京蛋白质组研究中心国家蛋白质组重点实验室	1	0	0.0	0.0
4	冷文川	北京蛋白质组研究中心国家蛋白质组重点实验室	2	0	0.0	0.0
5	秦钧	北京蛋白质组研究中心国家蛋白质组重点实验室	2	5	1.0	2.0