五味子与南五味子药材的DNA条形码鉴定

• 作者: 单会娇 吴亚男 康廷国 杨燕云 王冰 许亮 陈靓
• 来源期刊: 中国实验方剂学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 内转录间隔区2 DNA条形码 五味子 南五味子
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 资源与鉴定
• 页码范围: 66-71
• 页数: 6页
• 分类号: R282.5|R931.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.13422/j.cnki.syfjx.2016010066

摘要

目的:利用内转录间隔区2(ITS2)序列对五味子及南五味子药材进行DNA条形码鉴定.方法:对五味子和南五味子样品的ITS2序列进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和测序.从GenBank中下载了五味子属10个近缘种和2个外类群的ITS2序列.利用CodonCode Aligner软件拼接,采用MEGA 5.10计算相关数据,基于K2P模型构建聚类树(NJ树),应用Blast法进行鉴定分析.获取所测样品序列的ITS2二级结构信息,分析各样品间ITS2序列二级结构的差异.结果:五味子、南五味子样品序列长度分别为231,225～ 227 bp,Blast鉴定五昧子药材原植物为五味子Schisandra chinensis,南五味子药材原植物为华中五味子S.sphenanthera.五昧子与南五味子药材的种间K2P遗传距离(0.010 4 ～0.015 7)远大于五味子种内K2P遗传距离(0 ～0.002 5)和南五味子种内K2P遗传距离(0 ～0.005 1).在NJ树模型中,五味子样品被独聚为1支,南五味子样品被独聚为1支,皆表现出单系性,Bootstrap支持率较高,可与五味子属近缘种区分开.结论:以ITS2序列为标准的DNA条形码能够有效地鉴定五味子和南五味子药材.