斑马鱼核纤层蛋白Lamins的生物信息学分析

• 作者: 何志旭 叶芝旭 张衡璐 王志华 舒莉萍 黄惠敏
• 来源期刊: 中国实验动物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 斑马鱼 核纤层蛋白 lmna基因 进化树 共线性分析
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 351-357
• 页数: 7页
• 分类号: Q95-33
• 字数: 4592字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-4847.2016.04.004

摘要

目的：了解斑马鱼核纤层蛋白（ lamins）的重要遗传信息。方法在UCSC、Vega及Ensemble数据库上收集了不同物种核纤层蛋白家族相关蛋白质序列，利用ClustalX工具进行分析，并用MEGA 4?0软件绘制进化树；通过NCBI网站上BLAST工具将斑马鱼核纤层蛋白的蛋白质序列与不同物种的相对应的蛋白质序列进行对比，最后将人类、小鼠及斑马鱼的lamins基因信息，进行共线性分析。结果对核纤层蛋白相关基因进行生物信息学分析后显示斑马鱼的核纤层蛋白与人类的相似程度高，推断lmna、lmnb1和lmnb2基因在进化过程中高度保守。结论编码斑马鱼lamins的基因lmna、lmnb1和lmnb2等可能是人类LMNA、LMNB1和LMNB2等基因的直向同源物。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何志旭	贵州医科大学附属医院儿科学教研室	40	65	4.0	6.0
10	舒莉萍	贵州医科大学组织工程与干细胞实验中心	16	25	3.0	4.0
11	张衡璐	贵州医科大学附属医院儿科学教研室	1	0	0.0	0.0
12	黄惠敏	贵州医科大学附属医院儿科学教研室	1	0	0.0	0.0
13	叶芝旭	贵州医科大学附属医院儿科学教研室	1	0	0.0	0.0
14	王志华	贵州医科大学免疫学教研室	2	1	1.0	1.0