杨梅 S－SAP 分子标记体系的建立及应用

• 作者: 刘珠琴 焦云 章建红 舒巧云
• 来源期刊: 江西农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 杨梅 S-SAP 分子标记 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 园艺园林
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: S667.6
• 字数: 3440字
• 语种: 中文

摘要

基于杨梅全基因组Ty1－copia类型逆转座子LTR序列设计开发S－SAP引物组合，利用48份杨梅试材对其多态性指数进行评价，使用UPGMA（ Unweighted Pair Group Method with Arithmatic Mean）法，构建了系统聚类树，并进行了二维和三维主坐标分析，进而探讨了杨梅种质资源遗传亲缘关系。成功开发了18个杨梅S－SAP 引物组合，共扩增获得3739个条带，平均每个引物组合可扩增208个条带（100～500 bp），每个引物组合扩增条带数量范围为98～292，Shannon信息指数范围为0．2041～0．4522。其中，引物组合JY20的多态性最高，可扩增出292个条带。基于18个S－SAP引物组合，使用UPGMA法构建所有试材的系统聚类树，结果共分为3个组及3个亚组。聚类分析与主坐标分析结果高度相似，具有相同地域来源的品种大部分被划分于同一个分组，使用聚类分析与主坐标分析所得结果基本一致，但是聚类结果与果实色泽没有明显的关联性，利用三维主坐标分析更能全面且真实地反映杨梅品种间的亲缘关系。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘珠琴	宁波市农业科学研究院林业研究所	30	61	5.0	7.0
2	章建红	宁波市农业科学研究院林业研究所	27	64	5.0	7.0
3	舒巧云	宁波市农业科学研究院林业研究所	38	65	4.0	7.0
4	焦云	宁波市农业科学研究院林业研究所	21	20	2.0	4.0